ヤンセン社は精神医学、麻酔学はじめ様々な医学薬学研究の世界的パイオニアで、その新薬開発力が世界でも評価されていました。
当時日本でのより積極的な事業展開を計画していたヤンセン社と、海外の優れた新薬を導入し、製品ラインナップの拡充を図る協和発酵の意向が一致。両社は急速に信頼・協力関係を深めていきました。ヤンセン ファーマの前身であるヤンセン協和が誕生したのは1978年4月。ヤンセン・ファーマスーティカ（ベルギー）の株主である米国のトータル ヘルスケア企業ジョンソン・エンド・ジョンソンと、協和発酵との合弁によって発足しました。その後、研究開発から販売まで一貫した体制を築き上げ、そして設立から24年目の2002年1月、当初からの目的であった日本で、ジョンソン・エンド・ジョンソン全額出資会社としてヤンセン ファーマとして自立を果たしました。
2000年末に消化管運動賦活調整剤アセナリンの出荷停止に至るも、抗精神病薬リスパダールや、経口抗真菌剤イトリゾールの積極的なプロモーション活動に加え、2001年9月発売のトレドミン（SNRI)　　2002年デュロテップパッチ(持続性癌性疼痛治療剤）が実績に寄与することにより、大きく売上を伸張。　　また、2002年からは抗悪性腫瘍剤ロイスタチン、2006年にはベルケイド、2007年にはドキシルを発売しオンコロジー領域も充実。　2011年には初の抗体医薬としてモノクローナル　シンポニー。　アルツハイマー型痴呆症治療薬　ガランタミン　を発売し、コンスタントに新薬を上市していく研究開発力と販売力を兼ね備えた有望企業です。
2011年度12月期売上高はこれら大型新薬と既存品の好調な出荷に支えられ、805億円となりました。